Иногда при обновлении баз на SQL возникает системная ошибка, смысл сообщения о которой не совсем понятен:

 В процессе обновления информационной базы произошла критическая ошибка.
 по причине:
 Ошибка SDBL:
 Выход за пределы размерности результата

По моему опыту эта ошибка может быть связана с несоответствием новых и кэшированных данных или переполнением виртуальной таблицы. Помогают следующие процедуры:

1. Очистка профиля (проще всего удалить базу из стартового списка, затем снова прописать)

2. В дополнительных параметрах запуска можно добавить ключ /ClearCache 

3. Перезапустить службу 1С на сервере.